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肝脏病学
原始研究
肿瘤微环境塑造了肝细胞癌患者的先天淋巴样细胞
  1. 贝恩德•海因里希1，
  2. E迈克尔·格茨2，
  3. 亚历杭德罗一个谢弗2，
  4. 阿曼达·克雷格3.，
  5. 本杰明革命联合阵线1，
  6. Varun Subramanyam1，
  7. 约翰·C借债过度1，
  8. 劳伦斯·P digg1，
  9. 索菲娅•海因里希3.，
  10. Umberto罗1，
  11. 气马1，
  12. Chunhua严4，
  13. 胡应4，
  14. 狮头,赵5，
  15. Tsai-Wei沈5，
  16. 印度的七弦琴卡普尔6，
  17. 威廉德福6，
  18. 大卫·E·克莱恩7，
  19. 美林K Stovroff8，
  20. Harmeet年代Dhani8，
  21. 黔东南州康8，
  22. 托马斯·什拜因8，
  23. 鑫魏王3.，9，
  24. E Ruppin2，
  25. 亚历山大获得8，
  26. 蒂姆·F Greten1，9，
  27. Firouzeh Korangy1
  1. 1胸消化道恶性肿瘤科，美国国立卫生研究院国家癌症研究所癌症研究中心，贝塞斯达，马里兰美国
  2. 2癌症数据科学实验室，癌症研究中心，国家癌症研究所，国家卫生研究院，贝塞斯达，马里兰美国
  3. 3.美国国家癌症研究所癌症研究中心人类致癌性实验室，贝塞斯达，马里兰美国
  4. 4生物医学信息和信息技术中心，国家癌症研究所，国家卫生研究院，罗克维尔市，马里兰美国
  5. 5CCR-SF生物信息学小组，弗雷德里克国家癌症研究实验室，国家癌症研究所，国家卫生研究院，弗雷德里克，马里兰美国
  6. 6美国国立卫生研究院国立癌症研究所癌症研究中心实验移植和免疫治疗分院，贝塞斯达，马里兰美国
  7. 7病理实验室，病理学实验室，癌症研究中心，国家癌症研究所，国家卫生研究院，贝塞斯达，马里兰美国
  8. 8MedStar乔治城移植研究所，MedStar乔治城大学医院和转化移植医学中心，乔治城大学医学中心，华盛顿，哥伦比亚特区美国
  9. 9NCI CCR肝癌项目，国家卫生研究院，贝塞斯达，马里兰美国
  1. 对应到美国贝塞斯达国立卫生研究院Firouzeh Korangy博士，MD 20892;firouzeh.korangy在{}nih.gov

摘要

客观的肝细胞癌是一种典型的炎症相关癌症。组织内固有淋巴样细胞(ILCs)被认为可以控制肿瘤监测。在这里，我们研究了HCC中局部细胞因子环境如何控制ILCs。

设计我们对48例HCC患者的非肿瘤肝、肝缘和肿瘤核心的丰富ILCs进行了大体积RNA测序，以及流式细胞术和单细胞RNA测序。同时测量单细胞水平的蛋白质和RNA表达(AbSeq)确定了ILC亚群的精确特征。ILCs的体外培养用于验证硅片分析的结果。对来自大型HCC队列的rna测序数据进行分析，允许基于转录组特征进行分层和生存分析。

结果肿瘤、非肿瘤和边缘的RNA测序确定了肿瘤依赖的梯度，这些梯度与ILC的低存活率和可塑性控制有关。肝癌肝脏ILCs的单细胞RNA测序和流式细胞术在非肿瘤组织中发现了自然杀伤(NK)样细胞，当它们转化为肿瘤ILC1和NK样ilc3细胞时失去了细胞毒性。肿瘤ILC的组成是由细胞因子梯度介导的，它指导ILC向激活的肿瘤ilc2的可塑性。这是肝脏特异性的，在外周血单个核细胞的ILCs中未见。ILC2/ILC1比值高的患者在肿瘤中表达白介素-33，促进ILC2的生成，这与更好的生存有关。

结论我们的结果表明肿瘤细胞因子环境控制ILC的组成和HCC的结局。细胞因子的特异性变化通过诱导可塑性改变肿瘤中ILC的组成，改变ILC的功能。

  • 肝细胞癌
  • 免疫反应
  • 免疫调节
  • 免疫学
  • 肝脏免疫学

数据可用性声明

数据可在一个公共的、开放访问的存储库中获得。根据合理的要求提供数据。所有与研究相关的数据都包含在文章中或作为补充信息上传。本出版物中报道的单细胞RNA测序数据可以在基因表达综合(GEO;GSE179795)。大体积rna测序可以从GEO (GSE179746)访问。LCI和TIGER队列之前发表过，数据可以从GEO (GSE76297[4]和GSE14520[5])访问。肿瘤基因组图谱(TCGA)队列中所有肿瘤类型的数据先前已检索，如黑素瘤[6]所述。这些数据包括基因表达和存活。在此，我们分析了371例肝细胞癌(TGCA肿瘤型LIHC)。 Gene expression values were log-transformed before analysis.

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325288

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    脚注

    • 推特@BenniRuf, @JackMcVey14

    • 贡献者BH, TFG, FK:概念化，形式分析，调查和数据获取，方法论，项目管理，可视化，写作。BR, VS, MKS, HSD, JK, TMF, AK:调查和数据采集。MEG, AAS, AJC, BR, VS, JCM, LPD, SH, UR, CM, CY, YH, YZ, TWS, VK, WT, DK, XWW, ER, AK:形式分析。所有作者审阅并编辑了本文。

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