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胰腺
原始研究
干扰素调节因子1 (IRF1)控制低级别胰腺癌细胞的代谢程序
摘要
客观的胰腺导管腺癌(PDACs)包括形成假腺结构的低级别细胞的异质混合物和以非腺模式组织的高级别细胞的致密巢。我们之前报道过低等级的PDAC细胞显示干扰素调节因子1 (IRF1)的高表达,IRF1是干扰素(IFN)系统的关键转录因子,这表明IFN反应具有等级特异性,细胞内在激活。在这里,我们着手确定人类pdac中ifn调控反应激活的分子基础和功能影响。
设计我们首先证实了腺体分化与PDAC分子亚型以及IRF1和ifn刺激基因表达之间的相关性。接下来,我们使用无偏组学方法系统地分析了低级别和高级别PDAC细胞中基础和ifn调节的反应,以及IRF1对PDAC细胞基因表达程序和代谢谱的影响。
结果IRF1在低级别PDAC细胞中的高水平表达受到内胚层谱系决定转录因子的控制。irf1调控的基因表达使低级别PDAC细胞具有与抗原呈递和加工以及对IFN刺激的反应性相关的独特特性。值得注意的是,IRF1还控制低级别PDAC细胞的特征代谢谱,抑制线粒体呼吸和脂肪酸合成,这可能部分解释了其生长抑制活性。
结论IRF1将内胚层分化与控制抗原呈递和加工的基因表达以及典型PDAC细胞代谢特征的规范联系起来。
- 胰腺癌
- 干扰素
- 基因表达
- 能量代谢
数据可用性声明
数据可以在一个公共的、开放访问的存储库中获得。数据集可在Gene Expression Omnibus (GEO)数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo),登记号为GSE165950。