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  • 72年卷6
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肠道微生物群
原始研究
集成的宏基因组和代谢组学分析揭示了不同gut-microbiome-derived表型在早发性结直肠癌
  1. 程香港1,2,
  2. Lei梁1,2,
  3. 光刘3,
  4. Lutao杜4,
  5. Yongzhi杨1,2,
  6. Jianqiang刘5,
  7. deb史1,2,
  8. 新乡李1,2,
  9. Yanlei马1,2
  1. 1结直肠外科,上海复旦大学癌症中心,上海,中国
  2. 2肿瘤学系,复旦大学上海医学院,上海,中国
  3. 3广东宏源Pukang医疗技术有限公司,广东,中国
  4. 4临床实验室的部门,山东大学第二医院,济南,山东,中国
  5. 5内窥镜检查部门,上海复旦大学癌症中心,上海,中国
  1. 对应到Yanlei马博士的结直肠手术,上海复旦大学癌症研究中心,上海200032,中国;yanleima在}{fudan.edu.cn

文摘

客观的早发性结直肠癌的发病率(EO-CRC)是稳步增加。这里,我们旨在描述肠道微生物之间的相互作用,代谢产物和微生物酶EO-CRC病人和评估他们的潜力作为EO-CRC非侵入性的生物标记。

设计我们执行宏基因组和代谢组学分析,确定multiomics标记和CRC构造分类器与130年发现队列迟发性的CRC (LO-CRC), 114年EO-CRC主题和与健康对照组(97 LO-Control和100 EO-Control)。一个独立的38 LO-CRC, 24 EO-CRC LO-Controls 22和24 EO-Controls分析来验证结果。

结果与控制相比,减少了alpha-diversity是明显的在这两个,LO-CRC和EO-CRC科目。虽然常见变异存在,综合分析确定了不同LO-CRC和EO-CRC microbiome-metabolome关联。梭菌属nucleatum浓缩和短链脂肪酸消耗,包括减少微生物GABA生物合成和醋酸/乙醛代谢转向生产正是LO-CRC乙酰辅酶a。相比之下,multiomics EO-CRC往往伴随着丰富的签名Flavonifractor plauti和增加色氨酸,胆汁酸和胆碱代谢。值得注意的是,红肉intake-related物种升高,胆碱代谢物和KEGG orthology (KO) pldB cbh基因轴可能是潜在的肿瘤在EO-CRC刺激器。预测模型基于宏基因组,代谢组和KO基因标记了一个强大的分类性能区分EO-CRC和控制。

结论我们的大样本multiomics数据表明,改变microbiome-metabolome相互作用有助于解释EO-CRC和LO-CRC的发病机理。microbiome-derived的潜在生物标志物作为有前途的非侵入性的工具可以用于与EO-CRC个人的准确检测和区分。

  • 结肠直肠癌

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http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl - 2022 - 327156

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    脚注

    • CK,噢,GL、LD和YY同样起到了推波助澜的作用。

    • 贡献者YM负责整体内容作为担保人。CK,噢,GL、LD YY, YM实验设计。会、LD YY,杰,XL, DS和YM提供临床样本,进行实验。CK、YY和GL分析数据。CK、GL和YM写的手稿。所有作者手稿编辑。

    • 资金这项工作是支持由中国国家自然科学基金(81920108026号,81871964),国家一万计划(YM)年轻的高级人才,上海市科学技术发展基金(No.19410713300),上海的项目学术研究(排名20 xd1421200)领袖,CSCO-Roche肿瘤研究基金会(没有。y - 2019 -罗氏- 079)和复旦大学2025年卓越人才培养计划(YM)。作者借此机会感谢所有参与的患者和健康志愿者捐赠支持本研究的珍贵的样本用于这项研究。

    • 相互竞争的利益没有宣布。

    • 出处和同行评议不是委托;外部同行评议。

    • 补充材料此内容已由作者(年代)。尚未审查由BMJ出版集团有限公司(BMJ)和可能没有被同行评议。任何意见或建议讨论仅代表作者(年代)和不了BMJ的支持。和责任起源于BMJ概不负责任何依赖的内容。内容包括任何翻译材料,BMJ并不保证翻译的准确性和可靠性(包括但不限于当地法规、临床指南,术语,药物名称和药物剂量),和不负责任何错误或遗漏引起的翻译和改编或否则。

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