肠道微生物组在生理条件下的时空动态性

Shalon D,斑鸠R, Grembi J,等。在生理条件下分析人类的肠道环境。自然2023;617:581 - 591。doi: 10.1038 / s41586 - 023 - 05989 - 7

当前的肠道微生物研究严重依赖从凳子上的样品抽样风险从微生物群落区域信息的损失。Shalon等开发了一个可摄取的装置,方法收集近端腔的液体,小肠的中间和终端站点以及升结肠,启用宏基因组测序的足够的样本大小。

总的来说,确定了不同的微生物群落的个体内的唾液,肠道和粪便样本,以及肠道样本收集纵向沿肠道。对于微生物的基因,一个更高比例的序列映射到两个CAZyme(碳水化合物酶活性)和抗菌素耐药性基因从肠道样品与粪便样本。这允许species-gene协会的观察中本来没有stool-derived数据。

virome相比之下,一个细化的特点被发现没有多少肠道和粪便样本之间的偏差,而前噬菌体感应更好使用肠样品确认。

主人的空间差异蛋白质组遵循类似的模式微生物组成,显示一个大大异构比粪便样本从肠道蛋白质组剖面样品。

胆汁酸的检测而减少抽样从十二指肠浓度最低的粪便样本的检测。胆汁酸的修改是通过肠道微生物,观察早期解离的梯度和接合在消化道,导致不同的胆汁酸在每个采样站点概要文件。

这项研究展示了潜在的应用安全、非侵入性装置获得洞察人类肠道微生物的时空动态性影响各种生理状态和疾病的条件。

肠神经系统继电器心理压力,肠道炎症

施耐德K,空白的N,阿尔瓦雷斯Y,等…