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胰腺
原始研究
干扰素调节因子1 (IRF1)控制低级别胰腺癌细胞的代谢程序
  1. Gabriele Alfarano1，
  2. 马特奥Audano2，
  3. Pierluigi Di Chiaro1，
  4. 奇亚拉Balestrieri3.，
  5. 玛尔塔米兰1，
  6. 莎拉Polletti1，
  7. Paola Spaggiari4，
  8. 亚历山德罗Zerbi5，6，
  9. Giuseppe Riccardo diferia1，
  10. 尼科Mitro2，
  11. Gioacchino Natoli1
  1. 1IEO实验肿瘤科，欧洲肿瘤研究所，米兰、意大利
  2. 2药理学与生物分子科学学院，米兰理工大学，米兰、意大利
  3. 3.组学科学中心，圣拉斐尔科学研究所，米兰、意大利
  4. 4病理学系，IRCCS人道研究医院，Rozzano，米兰、意大利
  5. 5胰腺外科组，IRCCS人道研究医院，Rozzano，米兰、意大利
  6. 6Humanitas大学，Pieve Emanuele(米兰)、意大利
  1. 对应到Nico Mitro教授;nico.mitro在{}unimi.it;Gioacchino Natoli博士，欧洲肿瘤研究所，意大利米兰20141;gioacchino.natoli在{}ieo.it

摘要

客观的胰腺导管腺癌(PDACs)包括形成假腺结构的低级别细胞的异质混合物和以非腺模式组织的高级别细胞的致密巢。我们之前报道过低等级的PDAC细胞显示干扰素调节因子1 (IRF1)的高表达，IRF1是干扰素(IFN)系统的关键转录因子，这表明IFN反应具有等级特异性，细胞内在激活。在这里，我们着手确定人类pdac中ifn调控反应激活的分子基础和功能影响。

设计我们首先证实了腺体分化与PDAC分子亚型以及IRF1和ifn刺激基因表达之间的相关性。接下来，我们使用无偏组学方法系统地分析了低级别和高级别PDAC细胞中基础和ifn调节的反应，以及IRF1对PDAC细胞基因表达程序和代谢谱的影响。

结果IRF1在低级别PDAC细胞中的高水平表达受到内胚层谱系决定转录因子的控制。irf1调控的基因表达使低级别PDAC细胞具有与抗原呈递和加工以及对IFN刺激的反应性相关的独特特性。值得注意的是，IRF1还控制低级别PDAC细胞的特征代谢谱，抑制线粒体呼吸和脂肪酸合成，这可能部分解释了其生长抑制活性。

结论IRF1将内胚层分化与控制抗原呈递和加工的基因表达以及典型PDAC细胞代谢特征的规范联系起来。

  • 胰腺癌
  • 干扰素
  • 基因表达
  • 能量代谢

数据可用性声明

数据可以在一个公共的、开放访问的存储库中获得。数据集可在Gene Expression Omnibus (GEO)数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)，登记号为GSE165950。

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325811

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    脚注

    • GA, MA, PDC和CB是共同第一作者。

    • NM和GN是联合资深作者。

    • NM和GN的贡献相同。

    • GA、MA、PDC和CB贡献相同。

    • 调整通知这篇文章在网上发表后已被更正。附属单位4、5和6已更正。

    • 贡献者GA和MA在MM和SP的帮助下设计并完成了大部分实验。计算分析:PDC和CB。概念:GN, NM和GRD。GN和NM在所有作者的共同贡献下撰写了论文。监督:GN, NM和GRD。融资收购:GN, GRD和NM。担保人:GN。

    • 资金这项研究得到了AIRC、意大利癌症研究协会(AIRC调查员资助20251给GN和AIRC 5x1000资助ISM)和意大利卫生部(资助GR-2016-02361721给GRD)的支持。这项工作还得到了意大利卫生部“Ricerca Corrente”的部分支持，并向IEO IRCCS提供了5x1000资金。本研究中使用的PDAC样本的单细胞RNA-seq数据集由安大略省政府资助的安大略省癌症研究所提供。MM和GA得到了AIRC的长期奖学金支持。PDC得到了AIRC意大利研究金的支持。GRD部分得到翁贝托·韦罗内西基金会(FUV)的研究金的支持。

    • 相互竞争的利益没有宣布。

    • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。

    • 补充材料本内容由作者提供。它没有经过英国医学杂志出版集团有限公司(BMJ)的审查，也可能没有经过同行评审。讨论的任何意见或建议仅仅是作者的意见或建议，不被BMJ认可。BMJ不承担所有的责任和责任，因为任何依赖放置在内容上。如果内容包含任何翻译材料，BMJ不保证翻译的准确性和可靠性(包括但不限于当地法规，临床指南，术语，药物名称和药物剂量)，并且不对翻译和改编或其他方式引起的任何错误和/或遗漏负责。